צמחי המרפא בציפורי מיוצרים בגידול אורגני, ללא שימוש בחמרי הדברה רעילים או דשנים כימיים. הגידול האורגני מתיר שימוש רק בחמרים "ירוקים" – אשר אינם רעילים לאדם ולסביבה.
הפיקוח על הייצור האורגני מתבצע ע"י "אגריאור" – חברת פיקוח, מוסמכת הארגון לחקלאות אורגנית ומשרד החקלאות בישראל.
הגידולים השונים והפעילויות בחקלאיות מתועדות במסמכי החברה.